Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms