Protein–RNA interactions for Protein: Q64163

Tfdp2, Transcription factor Dp-2, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfdp2Q64163 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tfdp2Q64163 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tfdp2Q64163 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tfdp2Q64163 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tfdp2Q64163 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tfdp2Q64163 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Tfdp2Q64163 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Tfdp2Q64163 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Tfdp2Q64163 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Tfdp2Q64163 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfdp2Q64163 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms