Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms