Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScxQ64124 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ScxQ64124 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ScxQ64124 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms