Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms