Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
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