Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms