Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms