Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Lcn4Q62472 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Lcn4Q62472 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Lcn4Q62472 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Lcn4Q62472 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Lcn4Q62472 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Lcn4Q62472 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Lcn4Q62472 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Lcn4Q62472 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Lcn4Q62472 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Lcn4Q62472 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn4Q62472 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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