Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itga3Q62470 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itga3Q62470 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga3Q62470 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga3Q62470 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga3Q62470 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga3Q62470 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga3Q62470 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga3Q62470 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga3Q62470 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga3Q62470 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga3Q62470 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga3Q62470 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga3Q62470 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga3Q62470 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga3Q62470 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga3Q62470 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga3Q62470 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga3Q62470 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga3Q62470 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga3Q62470 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga3Q62470 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga3Q62470 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga3Q62470 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga3Q62470 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga3Q62470 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itga3Q62470 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itga3Q62470 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itga3Q62470 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga3Q62470 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itga3Q62470 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itga3Q62470 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga3Q62470 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga3Q62470 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga3Q62470 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga3Q62470 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga3Q62470 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga3Q62470 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga3Q62470 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga3Q62470 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga3Q62470 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga3Q62470 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga3Q62470 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga3Q62470 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga3Q62470 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga3Q62470 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga3Q62470 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga3Q62470 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga3Q62470 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga3Q62470 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga3Q62470 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga3Q62470 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga3Q62470 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga3Q62470 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga3Q62470 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga3Q62470 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga3Q62470 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga3Q62470 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itga3Q62470 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga3Q62470 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itga3Q62470 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga3Q62470 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga3Q62470 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga3Q62470 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga3Q62470 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga3Q62470 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga3Q62470 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga3Q62470 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga3Q62470 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga3Q62470 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga3Q62470 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga3Q62470 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga3Q62470 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga3Q62470 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga3Q62470 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga3Q62470 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itga3Q62470 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga3Q62470 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga3Q62470 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga3Q62470 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itga3Q62470 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga3Q62470 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga3Q62470 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga3Q62470 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga3Q62470 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga3Q62470 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga3Q62470 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga3Q62470 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga3Q62470 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga3Q62470 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga3Q62470 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga3Q62470 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga3Q62470 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga3Q62470 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga3Q62470 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga3Q62470 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itga3Q62470 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itga3Q62470 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga3Q62470 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itga3Q62470 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms