Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

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Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Sp4Q62445 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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Sp4Q62445 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Sp4Q62445 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Sp4Q62445 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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Sp4Q62445 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms