Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrhQ62361 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrhQ62361 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrhQ62361 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrhQ62361 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrhQ62361 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrhQ62361 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrhQ62361 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrhQ62361 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrhQ62361 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrhQ62361 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrhQ62361 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrhQ62361 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrhQ62361 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrhQ62361 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrhQ62361 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TrhQ62361 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrhQ62361 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrhQ62361 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrhQ62361 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrhQ62361 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrhQ62361 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrhQ62361 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrhQ62361 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrhQ62361 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TrhQ62361 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TrhQ62361 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TrhQ62361 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TrhQ62361 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TrhQ62361 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TrhQ62361 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TrhQ62361 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TrhQ62361 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrhQ62361 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrhQ62361 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TrhQ62361 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms