Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Taf6Q62311 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Taf6Q62311 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Taf6Q62311 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Taf6Q62311 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Taf6Q62311 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Taf6Q62311 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Taf6Q62311 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Taf6Q62311 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Taf6Q62311 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Taf6Q62311 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Taf6Q62311 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Taf6Q62311 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms