Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms