Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ssr4Q62186 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ssr4Q62186 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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