Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rbm38Q62176 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Rbm38Q62176 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Rbm38Q62176 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Rbm38Q62176 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Rbm38Q62176 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Rbm38Q62176 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Rbm38Q62176 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Rbm38Q62176 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Rbm38Q62176 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Rbm38Q62176 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbm38Q62176 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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