Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms