Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sin3bQ62141 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms