Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms