Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf9Q61179 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms