Protein–RNA interactions for Protein: Q61122

Nab1, NGFI-A-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nab1Q61122 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nab1Q61122 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms