Protein–RNA interactions for Protein: Q61068

Usp17la, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein A, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17laQ61068 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms