Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
JrkQ60976 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JrkQ60976 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
JrkQ60976 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
JrkQ60976 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
JrkQ60976 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
JrkQ60976 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
JrkQ60976 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms