Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms