Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms