Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms