Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms