Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms