Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms