Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q9

Uimc1, BRCA1-A complex subunit RAP80, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uimc1Q5U5Q9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms