Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms