Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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Tsr1Q5SWD9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Tsr1Q5SWD9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Tsr1Q5SWD9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Tsr1Q5SWD9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Tsr1Q5SWD9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Tsr1Q5SWD9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Tsr1Q5SWD9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Tsr1Q5SWD9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Tsr1Q5SWD9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Tsr1Q5SWD9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms