Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms