Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TefmQ5SSK3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TefmQ5SSK3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TefmQ5SSK3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TefmQ5SSK3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TefmQ5SSK3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TefmQ5SSK3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TefmQ5SSK3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TefmQ5SSK3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TefmQ5SSK3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TefmQ5SSK3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TefmQ5SSK3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TefmQ5SSK3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TefmQ5SSK3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TefmQ5SSK3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TefmQ5SSK3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TefmQ5SSK3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TefmQ5SSK3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms