Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms