Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms