Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms