Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf3Q5HZG4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms