Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms