Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Spire1Q52KF3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spire1Q52KF3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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