Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5935Q497S0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm5935Q497S0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm5935Q497S0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm5935Q497S0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm5935Q497S0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5935Q497S0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5935Q497S0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5935Q497S0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5935Q497S0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5935Q497S0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5935Q497S0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5935Q497S0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5935Q497S0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5935Q497S0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5935Q497S0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5935Q497S0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5935Q497S0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5935Q497S0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5935Q497S0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5935Q497S0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5935Q497S0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5935Q497S0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5935Q497S0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5935Q497S0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5935Q497S0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5935Q497S0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5935Q497S0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5935Q497S0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5935Q497S0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5935Q497S0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5935Q497S0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5935Q497S0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5935Q497S0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms