Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Garnl3Q3V0G7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms