Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc27Q3V036 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc27Q3V036 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc27Q3V036 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc27Q3V036 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc27Q3V036 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc27Q3V036 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc27Q3V036 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms