Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prdm6Q3UZD5 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms