Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdm5aQ3UXZ9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms