Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms