Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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BB287469Q3UT53 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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BB287469Q3UT53 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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