Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B230104I21RikQ3USW4 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms