Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Znf48Q3US17 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Znf48Q3US17 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Znf48Q3US17 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Znf48Q3US17 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Znf48Q3US17 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Znf48Q3US17 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Znf48Q3US17 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Znf48Q3US17 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Znf48Q3US17 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf48Q3US17 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf48Q3US17 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Znf48Q3US17 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf48Q3US17 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Znf48Q3US17 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf48Q3US17 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf48Q3US17 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Znf48Q3US17 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Znf48Q3US17 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Znf48Q3US17 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Znf48Q3US17 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Znf48Q3US17 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Znf48Q3US17 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Znf48Q3US17 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Znf48Q3US17 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Znf48Q3US17 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Znf48Q3US17 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Znf48Q3US17 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Znf48Q3US17 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Znf48Q3US17 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Znf48Q3US17 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Znf48Q3US17 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Znf48Q3US17 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Znf48Q3US17 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znf48Q3US17 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znf48Q3US17 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znf48Q3US17 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znf48Q3US17 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znf48Q3US17 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znf48Q3US17 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znf48Q3US17 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znf48Q3US17 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znf48Q3US17 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znf48Q3US17 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znf48Q3US17 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znf48Q3US17 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znf48Q3US17 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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