Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPW2

Elf3, ETS-related transcription factor Elf-3, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf3Q3UPW2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Elf3Q3UPW2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Elf3Q3UPW2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Elf3Q3UPW2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Elf3Q3UPW2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Elf3Q3UPW2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Elf3Q3UPW2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Elf3Q3UPW2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Elf3Q3UPW2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Elf3Q3UPW2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Elf3Q3UPW2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Elf3Q3UPW2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Elf3Q3UPW2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Elf3Q3UPW2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Elf3Q3UPW2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Elf3Q3UPW2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Elf3Q3UPW2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms